Die Profiloberstufe ist wohl eines der meist umstrittensten Themen an Pinnebergs Gymnasien. Besonders die hohen und unterschiedlichen Stunden sowie die Einschränkung beim Auswählen der Fächer werden häufig von Schülern, Eltern und Lehren kritisiert. Doch ab 2010 könnte unter anderem die von vielen erhoffte Abschaffung der zweiten Fremdsprache vollbracht sein.
Die neuen Profilfächer sind vorerst auf der THS-Homepage veröffentlicht. Demzufolge (ohne Gewähr) würden an der THS zwei naturwissenschaftliche Profile (Bio, Physik), ein Sportprofil, ein Geschichtsprofil und ein sprachliches Profil ab Sommer 2010 angeboten werden. Der Infoabend für die neue Profiloberstufe wurde hingegen abgesagt, da die jetzige Profilplanung aufgrund von politischen Änderungen aus Kiel womöglich schon bald über den Haufen geworfen werden könnte! Das Warten geht erst einmal weiter.